Grupa za organsku proizvodnju obavlјa poslove koji se odnose na:

• pripremu stručnih osnova za izradu nacionalnih propisa usklađenih sa EU acquis i učešće u izradi strateških dokumenata;
• uspostavlјanje i održavanje efikasnog kontrolnog sistema u oblasti organske proizvodnje,nutvrđivanje ispunjenosti  uslova za obavlјanje poslova kontrole i sertifikacije i predlaganje Spiska ovlašćenih organizacija;
• vršenje nadzora nad radom ovlašćenih kontrolnih organizacija;
• praćenje uvoza i izvoza organskih proizvoda; 
• odobravanje: odstupanja od metoda organske bilјne i stočarske proizvodnje i pravila prerade u organskoj proizvodnji, upotrebe reproduktivnog materijala iz konvencionalne proizvodnje posle perioda konverzije, skraćenja, odnosno produženja perioda konverzije u organskoj bilјnoj i stočarskoj proizvodnji; 
• vođenje evidencije i spiska o ovlašćenim kontrolnim organizacijama;
• prikuplјanje godišnjih izveštaja o organskoj proizvodnji od ovlašćenih kontrolnih organizacija;
• vođenje zbirne evidencije o organskoj proizvodnji i dostavlјanje podataka za EUROSTAT;
• predlaganje i učešće u sprovođenju projekata iz oblasti organske proizvodnje;
• učešće u radu  Stručnog saveta za organsku proizvodnju;
• saradnju i razmenu informacija sa nadležnim institucijama u oblasti organske proizvodnje iz zemlјe i inostranstva i praćenje EU zakonodavstva u oblasti organske proizvodnje;
• obavlјa i druge poslove iz ove oblasti.