Лабораторија за фитосанитарна испитивања и испитивања квалитета семена обавља послове који се односе на:

• активности у вези са извођењем лабораторијских испитивања у области здравља биља, односно испитивања присуства регулисаних штетних организама, карантинских и економских штетних организама у узорцима биљака и регулисаним биљним производима;
• активности у вези са испитивањем присуства остатака пестицида у храни биљног порекла и храни за животиње;
• проучавање етиологије и епидемиологије болести биља и процену ризика од уношења и ширења штетних организама биљака;
• сарадњу и размену информација са овлашћеним лабораторијама у земљи и националним лабораторијама других земаља;
• размену информација у вези са дијагностичким активностима и другим повезаним стручним пословима;
• развијање, валидацију и верификацију метода, разраду и примену развијених метода;
• успостављање система квалитета и акредитације;
• јачање стручно-техничких лабораторијских капацитета у области лабораторијске дијагностике штених организама;
• организовање потребних обука лабораторијског особља и припрему програма стручног усавршавања у складу са прописима који регулишу здравље биља;
• активности у вези са испитивањем квалитета семена (физичка, биолошка и биохемијска испитивањa) и здравственог стања семена и садног материјала ратарског, повртарског, лековитог и ароматичног биља, испитивање квалитета семена, испитивање клијавости смена, узорковања семена за физичка, биохемијска и биолошка испитивања, припрему и спровођење протокола за рад банке биљних гена, чување колекције семена и садног материјала.