Лабораторија за физичко-хемијска испитивања хране и хране за животиње обавља послове који се односе на:

• активности у вези са извођењем лабораторијских испитивања физичко-хемијских параметара хране и хране за животиње, као што су остаци пестицида, садржај метала и других хемијских контаминената;
• примену савремених инструменталних метода попут гасне хроматографије са тандем масеним спектрометром, течне хроматографије са масеним спектрометром високе резолуције, течне хроматографије са тандем масеним спектрометром и индуктивно спрегнуте плазме са масеним спектрометром;
• организовање и учешће лабораторија у екстерним проверама квалитета рада лабораторија;
• успостављање система квалитета и акредитације;
• сарадњу са овлашћеним лабораторијама и националним лабораторијама других земаља у области безбедности хране;
• размену информација са другим лабораторијама;
• развијање, разраду и примену метода развијених у лабораторији и примену стандардних метода, валидацију и верификацију лабораторијских метода
• организовање потребних обука лабораторијског особља и припрему програма стручног усавршавања у складу са прописима који регулишу безбедност хране и хране за животиње;
• припрему процедура узорковања, руковања узорцима, транспорта и чувања узорака; рад са референтним материјалима за потребе анализа у области безбедности хране и хране за животиње;
• Лабораторија сарађује са референтним лабораторијама Европске уније кроз редовна учешћа у програмима испитивања оспособљености лабораторије за методе одређивања резидуа пестицида – EUPT (енг. European Union Proficiency Tests)  за воће и поврће, за житарице и храну за животиње и за „singleˮ резидуалне методе (енг. EU Reference Laboratories for Residues of Pesticides). Такође сарађује са акредитованим PT (енг. Proficiency Testing) провајдерима према стандарду ISO/IEC 17043, у оквиру редовних активности екстерног обезбеђења валидности резултата.
• Лабораторија сарађује са EFSA (енг. European Food Safety Authority) везано за хемијски мониторинг и резултате испитивања узорака хране.